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La SEIO fue incialmente la Sociedad Española de Investigación Operativa y fue creada el 12 de Febrero de 1962. Su constitución tuvo lugar en los locales del Instituto de Investigaciones Estadísticas del Consejo Superior de Investigaciones Científicas en el transcurso de una reunión a la que asistieron cincuenta y dos personas de diversos ámbitos, todas ellas interesadas en los métodos de la Investigación Operativa y en la propagación de la teoría y práctica de esta disciplina en España.
En la Junta General Extraordinaria celebrada el día 30 de Junio de 1976, se amplió el campo de actividades de la SEIO a la Estadística y a la Informática. En la Junta General celebrada el 20 de Diciembre de 1984 se acordó modificar sus estatutos, nombre y cometidos. La SEIO pasó entonces a llamarse Sociedad de Estadística e Investigación Operativa. En marzo de 1999 se modificaron ciertos artículos de los estatutos quedando su redacción como figura en la actualidad. Actualmente al sociedad cuenta con cerca de 700 socios.
Los presidentes de la SEIO desde su constitución hasta la fecha han sido los siguientes (por orden de antigüedad):
Fermín de la Sierra Sixto Ríos García Pilar Ibarrola MuñozMarco A. López CerdáDaniel Peña Sánchez de RiveraElías Moreno BasJesús T. Pastor CiuranaRafael Infante MacíasPedro Gil ÁlvarezDomingo Morales GonzálezIgnacio García JuradoJosé Miguel Angulo Ibáñez
Leandro Pardo Llorente
Emilio Carrizosa Priego
Jesús López Fidalgo
Publicaciones sobre la historia de la SEIO
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La Sociedad 
